Microsoft Edgeからではお気に入りのURLを修正できないので、お気に入りが保存されているフォルダを直接開いて、直そうと思ったのですが、どこに保存されているのかわからず、調べてみました。
Microsoft Edgeのお気に入りは以下に保存されています。
%localappdata%\Packages\Microsoft.MicrosoftEdge_8wekyb3d8bbwe\AC\MicrosoftEdge\User\Default\Favorites
お気に入りのファイル形式はIEと同じもののようです。
【追記】(2015/11/14)
Windows 10 (バージョン 1511)にしたら、お気に入りの保存方法が変わったようです。
上記のフォルダにあるお気に入りとEdge上に表示されるお気に入りが一致していません。
Microsoft Edgeのお気に入りが保存されているフォルダ
2015年08月04日(火) 21時31分